La Svizzera ha riconosciuto la Repubblica di Guinea-Bissau il 13 agosto 1974 e stabilito relazioni diplomatiche con il nuovo Stato nel 1980.
Gli scambi economici e commerciali tra i due Paesi sono modesti.
Fino al 2002, la Direzione dello sviluppo e della cooperazione (DSC) ha sostenuto la Guinea-Bissau nel settore dello sfruttamento sostenibile delle risorse naturali e le ha fornito aiuto umanitario durante la guerra civile del 1998.
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