Unité d’état major, le Secrétariat général assiste et conseille le chef du Département dans ses activités quotidiennes. Sa mission consiste en particulier à:

• coordonner les dossiers destinés au Parlement et au Conseil fédéral,
• informer le public sur les activités du Département,
• assurer l’égalité des chances au DFAE,
• vérifier l’efficacité du pilotage interne et des systèmes de contrôle, dans la sphère d’attribution du Département,
• traiter toute question historique qui intéresse le Département.

Présence Suisse est rattachée au Secrétariat général.